Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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CHD4Q14839 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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CHD4Q14839 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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CHD4Q14839 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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CHD4Q14839 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHD4Q14839 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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