Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HNF4GQ14541 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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