Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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SCARF1Q14162 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCARF1Q14162 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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