Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RUNX3Q13761 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RUNX3Q13761 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms