| RUNX3 | Q13761 | ZNF527-203 | ENST00000483919 | 1142 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANAPC13-205 | ENST00000511751 | 896 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAP1LC3B2-202 | ENST00000556529 | 660 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCN1B-204 | ENST00000596348 | 1176 nt | TSL 5 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RBM8A-206 | ENST00000632555 | 751 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL645728.2-202 | ENST00000641679 | 227 nt | BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ETV3-201 | ENST00000326786 | 1539 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162231.1-201 | ENST00000421828 | 1525 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TOPAZ1-201 | ENST00000309765 | 5334 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARRB2-204 | ENST00000412477 | 1779 nt | TSL 2 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBQLN1-201 | ENST00000257468 | 2299 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACAP1-201 | ENST00000158762 | 2512 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TLE3-212 | ENST00000558201 | 2766 nt | TSL 5 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.11 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TCOF1-206 | ENST00000445265 | 4825 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NFATC3-222 | ENST00000575270 | 3824 nt | TSL 5 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAPBPL-201 | ENST00000266556 | 1741 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PACSIN2-205 | ENST00000407585 | 3080 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OVCH1-AS1-204 | ENST00000641955 | 5529 nt | BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAF3-201 | ENST00000344293 | 4872 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NR2C1-203 | ENST00000393101 | 1822 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CACNB3-203 | ENST00000540990 | 1814 nt | TSL 2 BASIC | 15.71 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP72-201 | ENST00000264935 | 2434 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM120AOS-201 | ENST00000375412 | 2771 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCDC90B-203 | ENST00000525503 | 1919 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VARS-215 | ENST00000375663 | 4312 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TSPAN3-201 | ENST00000267970 | 6467 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAB40C-205 | ENST00000539661 | 2609 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEPDC7-202 | ENST00000311388 | 2012 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANKRD17-201 | ENST00000330838 | 7734 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCMF1-201 | ENST00000409785 | 7568 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABHD18-203 | ENST00000444616 | 2129 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLUD2-201 | ENST00000328078 | 2493 nt | APPRIS P1 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139099.2-201 | ENST00000555043 | 2469 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRC59-201 | ENST00000225972 | 2910 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDHR1-201 | ENST00000332904 | 2694 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TUBB3-206 | ENST00000554444 | 1978 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1orf43-205 | ENST00000368519 | 1163 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C9orf24-203 | ENST00000379126 | 496 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR663B-201 | ENST00000408361 | 115 nt | BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP1S3-204 | ENST00000409375 | 552 nt | TSL 3 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC25A24P2-201 | ENST00000415059 | 510 nt | BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL450469.1-201 | ENST00000418953 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDRT15-201 | ENST00000420162 | 766 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007731.4-201 | ENST00000420225 | 652 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDRT15-202 | ENST00000431716 | 655 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01762-204 | ENST00000434879 | 436 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VGLL4-214 | ENST00000451674 | 938 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091804.1-201 | ENST00000486888 | 567 nt | BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC35G4-201 | ENST00000588001 | 1017 nt | APPRIS P1 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011495.3-201 | ENST00000596472 | 427 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KC6-205 | ENST00000599934 | 556 nt | TSL 4 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL023775.1-201 | ENST00000454907 | 1746 nt | BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LY9-204 | ENST00000368039 | 1364 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GRB7-205 | ENST00000445327 | 2197 nt | TSL 2 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL079303.2-201 | ENST00000555107 | 2613 nt | TSL 3 BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC127383.1-201 | ENST00000444697 | 1800 nt | BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138028.6-201 | ENST00000616106 | 1482 nt | BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF74-202 | ENST00000400451 | 3159 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHUK-201 | ENST00000370397 | 3625 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ICAM3-201 | ENST00000160262 | 1934 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MPL-201 | ENST00000372470 | 1908 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGAP11B-210 | ENST00000622744 | 2042 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARMC5-203 | ENST00000457010 | 4844 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026471.1-201 | ENST00000564629 | 3026 nt | BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ICMT-201 | ENST00000343813 | 4771 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.7 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HILPDA-201 | ENST00000257696 | 1349 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ECSIT-209 | ENST00000591104 | 1319 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LOXL3-203 | ENST00000409249 | 2431 nt | TSL 5 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAPLN-202 | ENST00000340738 | 5834 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANKRD30BP2-201 | ENST00000435744 | 1610 nt | BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068831.1-204 | ENST00000501381 | 1621 nt | TSL 2 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDZD8-201 | ENST00000334464 | 9699 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRSS54-201 | ENST00000219301 | 1810 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHYH-203 | ENST00000396920 | 1829 nt | TSL 5 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLCB1-201 | ENST00000338037 | 7092 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM141-201 | ENST00000290079 | 768 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL021453.1-201 | ENST00000333487 | 2989 nt | TSL 2 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DBI-203 | ENST00000393103 | 599 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF3FP3-201 | ENST00000434851 | 1086 nt | BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POM121L10P-201 | ENST00000436994 | 1285 nt | BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX5BP1-201 | ENST00000507622 | 393 nt | BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCARNA20.5-201 | ENST00000516991 | 142 nt | BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FBXL8-208 | ENST00000521920 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPO-215 | ENST00000539820 | 1157 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007569.1-201 | ENST00000550306 | 600 nt | TSL 3 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011603.1-201 | ENST00000553174 | 717 nt | TSL 2 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02205-201 | ENST00000559752 | 239 nt | TSL 5 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012322.1-201 | ENST00000561657 | 861 nt | TSL 3 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NIP7-208 | ENST00000569637 | 1099 nt | TSL 2 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXNDC17-202 | ENST00000570330 | 459 nt | TSL 2 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAMD11P1-201 | ENST00000571429 | 661 nt | BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAT9-222 | ENST00000583476 | 583 nt | TSL 3 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC020914.3-201 | ENST00000594712 | 304 nt | BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IKZF1-217 | ENST00000612658 | 962 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGFR2-215 | ENST00000457416 | 3061 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GATAD1-201 | ENST00000287957 | 3361 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZSWIM8-AS1-201 | ENST00000456638 | 1460 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BMP1-201 | ENST00000306349 | 2626 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BBS2-218 | ENST00000568104 | 2623 nt | TSL 5 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEC23A-203 | ENST00000545328 | 2734 nt | TSL 2 BASIC | 15.69 | ■□□□□ 0.1 | | |