Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ALCAMQ13740 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms