Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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HTR4Q13639 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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HTR4Q13639 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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HTR4Q13639 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTR4Q13639 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTR4Q13639 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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