Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MTMR3Q13615 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms