Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EIF4EBP1Q13541 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms