Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms