Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSMD2Q13200 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms