Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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