Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms