Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTP4A2Q12974 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTP4A2Q12974 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTP4A2Q12974 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTP4A2Q12974 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTP4A2Q12974 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTP4A2Q12974 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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