Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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