Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJQ12913 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRJQ12913 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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