Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCC8Q09428 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC8Q09428 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCC8Q09428 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms