Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TFF3Q07654 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms