Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABPB1Q06547 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms