Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABPAQ06546 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms