Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms