Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
CD164Q04900 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CD164Q04900 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms