Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms