Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RELAQ04206 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms