Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARID5AQ03989 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms