Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms