Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAV1Q03135 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms