Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FAM153A-202ENST00000393518 1138 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RPL35P3-201ENST00000403133 371 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SNCA-207ENST00000502987 731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CSRP3-201ENST00000265968 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CENPS-201ENST00000309048 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC005037.1-202ENST00000332935 820 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AP001171.1-201ENST00000436373 864 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC144568.2-201ENST00000522481 944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB1Q02641 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms