Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF17Q02223 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms