Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM189BP81408 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM189BP81408 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms