Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HERVK_113P63121 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms