Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNAP25P60880 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNAP25P60880 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms