Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVPABLB-1P60509 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVPABLB-1P60509 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms