Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AIF1P55008 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AIF1P55008 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms