Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIRAP54198 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms