Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
POLR2KP53803 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms