Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms