Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COPAP53621 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COPAP53621 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPAP53621 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPAP53621 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms