Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCA4P51532 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms