Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms