Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ME1P48163 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ME1P48163 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ME1P48163 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ME1P48163 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ME1P48163 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ME1P48163 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ME1P48163 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms