Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP2P42575 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms