Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFBP38117 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms