Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZEB1P37275 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms