Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms