Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms