Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms