Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTNNA1P35221 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms