Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD38P28907 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD38P28907 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms