Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCAP28676 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GCAP28676 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms