Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PLNP26678 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PLNP26678 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PLNP26678 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms